По прошествии нескольких дней использования ownCloud хочу перечислить основные найденные условия (почти) безпроблемной работы с этим сервисом в Windows.
1. Не использовать прокси, тем более с авторизацией.
2. Не использовать расширение Проводника.
3. Поддерживать активность каждые три минуты со всех машин, например, через шедулер таким скрпитом: http://pastebin.com/XqWgDGzH
И всё будет работать очень даже неплохо ^^ В Линупсе ещё не пробовала, но думаю, что там список точно такой же.