Потребовалось срочно переехать ownCloud с одного домена на другой. Ну тоесть всё остаётся на своих местах, только меняется имя домена. Расшаренных файлов нет, связей с другими облаками нет. Думала, что придётся всё переустанавливать (а заодно обновить наконец бубунту), но не тут-то было. Сначала сгенерировала сертификаты на новый домен (добавила конфиг в getssl и запустила), потом прописала новый домен в config.php, следом заменила старый домен на новый в конфигах сайтов Апача. Перезапустила Апач. Зашла на сайт и проверила – вроде бы порядок. По новому адресу открывается тот же ownCloud с теми же пользователями и файлами. Но тут отвалился клиент на машине – ему сертификат перестал нравиться (на Апаче по дефолту самоподписанный сертификат на example.com во избежание). Закрыла его, пошла искать конфиг. Оказалось, что хранится он не в Application Data, а в Local Settings. Открыла owncloud.cfg и заменила там домен. Запустила клиент. Тот затребовал пароль для учётки. Дала ему пароль, на чём он и успокоился. Вроде бы пока всё работает.
// Кстати, оказалось, что обновлялки клиент в ту же папку качает. Я пропустила несколько, так он их там и схоронил.